و يدخل إلى المسجد من ثلاثة عشر موضعا بعشرين بابا باب حطة بابي النبي ( صلى الله عليه وسلم ) ابواب محراب مريم بابى الرحمة باب بركة بني اسرائيل ابواب الاسباط ابواب الهاشميين باب الوليد باب إبراهيم باب أم خالد باب داود وفيه من المشاهد محراب مريم وزكريا و يعقوب و الخضر و مقام النبى و جبريل وموضع النمل والنور والكعبة والصراط متفرقة فيه وليس على الميسرة اروقة والمغطى لايتصل بالحائط الشرقي ومن اجل هذا يقال لايتم فيه صف أبدا وانما ترك هذا البعض لسببين أحدهما قول عمر اتخذوا في غربي هذا المسجد مصلى للمسلمين فتركت هذه القطعة لئلا يخالف والثاني أنهم لو مدوا المغطى إلى الزاوية لم تقع الصخرة حذاء المحراب فكرهوا ذلك والله أعلم
وطول المسجد ألف ذراع بذراع الملك الاشباني وعرضه سبعمائة وفي سقوفه من الخشب أربعة آلاف خشبة وسبعمائة عمود رخام وعلى السطح خمسة وأربعون ألف شقفة رصاص وحجم الصخرة ثلاثة وثلاثون ذراعا في سبعة وعشرين والمغارة التي تحتها تسع تسعا وستين نفس